Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fgfbp3Q1HCM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms