Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam171bQ14CH0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam171bQ14CH0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms