Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ptchd1Q14B62 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms