Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms