Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kndc1Q0KK55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms