Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pate4Q09098 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms