Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms