Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms