Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms