Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms