Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms