Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms