Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Top2aQ01320 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Top2aQ01320 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms