Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms