Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms