Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabpaQ00422 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabpaQ00422 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms