Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb4P99026 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms