Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brca2P97929 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms