Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcc1P97496 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms