Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bop1P97452 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms