Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp1P97350 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms