Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3aP84244 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms