Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ptprn2P80560 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ptprn2P80560 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ptprn2P80560 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ptprn2P80560 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ptprn2P80560 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprn2P80560 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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