Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Otx1P80205 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms