Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms