Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm3P62311 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm3P62311 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm3P62311 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm3P62311 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms