Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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