Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnnP61807 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnnP61807 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnnP61807 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnnP61807 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms