Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms