Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms