Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap25P60879 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 410.9 ms