Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ythdf1P59326 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms