Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms