Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms