Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp25P57080 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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