Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp5P56399 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms