Protein–RNA interactions for Protein: P55144

Tyro3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyro3P55144 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tyro3P55144 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tyro3P55144 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms