Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms