Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgd1P52734 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms