Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CcnfP51944 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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