Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LumP51885 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LumP51885 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LumP51885 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LumP51885 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LumP51885 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LumP51885 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms