Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccr5P51682 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms