Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms