Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms