Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RorcP51450 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RorcP51450 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RorcP51450 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RorcP51450 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RorcP51450 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RorcP51450 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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