Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms