Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcls1P49710 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms