Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms