Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms