Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-2P42586 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms